2023年全国冷冻电镜软件技术开发与应用研讨会

重要提示:会议信息包含但不限于举办时间,场地,出席人员等可能会随着时间发生变化,报名参会或沟通合作请先联系主办方确认。如果您发现会议信息不是最新版,可以通过主办方邮箱将包含最新会议信息的链接或文件通过邮箱发送至support@huiyi-123.com,审核人员将会尽快为您更新到最新版本。
会议时间:2023-12-17 ~ 2023-12-21
举办场地:杭州馨乐庭青山湖公寓酒店 导航
主办单位:清华大学 更多会议
大会主席:领域专家
会议介绍

冷冻电镜作为结构生物学中解析蛋白质等生物大分子高分辨率结构的关键技术,为直接理解生命活动提供了重要的信息。冷冻电镜技术在近十年的高速发展中,中国科学家在新方法建立和技术开发与应用中发挥了重要作用,前沿技术层出不穷,推动了众多具有影响力的研究成果。为继续提升我国在冷冻电镜前沿技术的应用能力,并进一步促进在冷冻电镜领域方法技术的开发能力,培养更多相关人才,使得我国在结构生物学中持续做出重大贡献,故此举办“全国冷冻电镜软件技术开发与应用研讨会”。

会议内容将涵盖冷冻电镜单颗粒技术和冷冻电子断层技术中图像处理及三维重构的前沿算法和软件技术,通过软件作者或高级用户深度讲解,帮助冷冻电镜用户更好地理解和应用最先进的数据处理原理和技术。本次会议由清华大学、中国科学院生物物理研究所和中国生物物理学会冷冻电子显微学分会主办,将于2023年12月17-21日浙江省杭州市临安区举行,由水木未来(杭州)科技有限公司协助承办。为保证充分交流和受计算设备数量限制,会议最大规模限定为100人。

本次会议将邀请多位立足于冷冻电镜计算方法和软件开发的研究者,采用报告 + 软件操作 + 讨论的方式,系统地介绍相关的算法和软件,并结合现场使用让用户能够理解和实际应用这些技术。本次会议也希望能通过用户和开发者的交流,将实际科研中面临的技术困难反馈给从事方法和软件开发的研究者,促进相互学习和交流,共同推动整个领域的前进发展。

召集人:

李雪明,清华大学

章新政,中国科学院生物物理研究所

以下内容为GPT视角对全国冷冻电镜软件技术开发与应用相关领域的解读,仅供参考:

全国冷冻电镜软件技术开发与应用发展现状

冷冻电子显微镜(Cryo-Electron Microscopy,简称Cryo-EM)是一种用于观察生物样品的高分辨率结构分析技术,尤其在蛋白质结构解析方面具有重要价值。近年来,随着计算能力的提升和数据处理技术的进步,冷冻电镜软件技术得到了快速发展。

  1. 软件技术开发:目前,国际上已经有一些成熟的冷冻电镜软件,如SPIDER、RELION、FREALIGN等,这些软件可以帮助科学家更有效地处理和分析冷冻电镜数据,从而得到高分辨率的结构图像。

  2. 技术应用:冷冻电镜技术在生物学、医学等领域得到了广泛应用。例如,科学家们利用冷冻电镜技术成功解析了许多重要蛋白质和病毒的三维结构,这对于理解它们的功能机制和药物设计具有重要意义。

  3. 国内发展现状:在国内,冷冻电镜技术也得到了广泛关注和发展。例如,中国科学院生物物理研究所、北京大学、清华大学等机构都在积极开展冷冻电镜技术的研究和应用。同时,也有一些国内的科研团队在进行冷冻电镜软件的开发工作。

冷冻电镜软件技术开发与应用有哪些实践案例

  1. 西湖大学的冷冻电镜数据分析平台:西湖大学开发了一个智能化冷冻电镜数据分析平台,为用户提供了全套的冷冻电镜数据分析计算、存储解决方案。这个平台可以直接接入和控制冷冻电镜光学系统,实现从数据采集到二维和三维生物结构的解析。

  2. 蛋白质结构解析:冷冻电镜技术已经被广泛应用于蛋白质结构解析。例如,2017年,三位科学家因使用冷冻电镜技术解析了原纤蛋白的结构而获得了诺贝尔化学奖。

  3. 新冠病毒病毒的结构解析:在新冠疫情中,冷冻电镜技术也被用于解析新冠病毒的结构,这对于理解新冠病毒的感染机制和药物设计具有重要意义。

  4. 药物设计:冷冻电镜技术也可以用于药物设计。通过解析药物分子与靶标蛋白的结合模式,可以有助于优化药物的药效和减少副作用。

冷冻电镜软件技术开发与应用领域有哪些知名企业或品牌

  1. MRC Laboratory of Molecular Biology (LMB) :LMB是英国的一家研究机构,其开发的软件如Relion和Frealign在冷冻电镜数据处理领域有广泛的应用。

  2. Janelia Research Campus:这是霍华德·休斯医学研究所(Howard Hughes Medical Institute)的一个研究机构,其开发的软件如Volta和Phenix在冷冻电镜数据处理领域也有重要的影响。

  3. Birkbeck, University of London:伦敦大学伯贝克学院的研究团队在冷冻电镜数据处理领域也有重要的贡献,其开发的软件如Spider和Eman2在冷冻电镜数据处理领域有广泛的应用。

  4. Globals Software Solutions:这是一家专门从事生物信息学软件开发和服务的公司,其开发的软件如Coot和PyMOL在冷冻电镜数据处理领域也有广泛的应用。

会议日程
2023年12月17日 - 下午 报到 *报到当天提供简单晚餐
2023年12月18-21日 - 会议时间
2023年12月21日 - 中午 会议结束,午餐,离会
联系方式

会议联系人

(如有任何问题,请联系会议联系人)

联系人:张晓晶

电话:13717973166

邮箱:zhangxiaojing@tsinghua.edu.cn

参会企业
主办单位 - 中国科学院生物物理研究所
主办单位 - 中国生物物理学会冷冻电子显微学分会
承办单位 - 水木未来(杭州)科技有限公司
参会事项

目前会议已经邀请到多位报告人讲解他们最新的方法和软件,或者介绍常用软件的原理和使用技巧,如下:

软件名称

介绍

报告人

CTFMeasure

CryoET倾转系列联合离焦量测量

清华大学

李雪明

isSPA

细胞原位三维重构算法

中国科学院生物物理所

章新政

SIRM

矫正单颗粒三维重构中取向优势导致的密度畸变

中国科学院生物物理所

章新政

CryoSieve

使用少量颗粒提高单颗粒重构分辨率

深圳医学科学院SMART

胡名旭

ISONet

CryoET密度图降噪和缺失楔矫正

中国科学院深圳先进技术研究院

陶长路

REST

CryoET密度图降噪和分子分割

中国科学院生物物理所

朱平

MPicker

CryoET中膜蛋白的可视化与挑选

清华大学

李雪明

CryoNet和CryoFold

单颗粒冷冻电镜密度图建模

清华大学

张强锋组 徐魁

EMReady和EMBuild

冷冻电镜密度图质量提升和结构建模

华中科技大学

黄胜友

Warp/M

基于Warp/M与Relion的cryo-ET数据处理

中国科学院生物物理所

薛亮

参会设备要求:

  • 会议中的软件操作环节需要参会者的电脑通过无线网络连接到指定的云服务器上,通过远程桌面进行操作。

  • 参会者需自行准备并携带笔记本电脑。

会议注册和注册费

  • 会议注册请访问下面腾讯文档链接,填写参会人详细参会信息进行注册。

注册链接:https://docs.qq.com/form/page/DRldpQlZTa3BBQktr#/fill

  • 注册完成后,需支付会议费才能完成注册。会议缴费为银行转账(付款账号和说明见后面内容)。

  • 为方便支付会议费,也可以通过扫描微信付款二维码付款(见下文)。会议开始前一周(12月10日)注册截止。会议费包括会议期间发生的会议成本、餐费和住宿费(4天住宿)。

会议费有如下三个可选的方案,请根据您的情况选择相应的会议费金额缴纳。

会议费标准

2023年11月27日前(含)注册、缴费

2023年11月28日后(含)注册、缴费

单人单间

3200元

3500元

两人住一间(注册时需填写同住参会者姓名)

2600元

2900元

不需要住宿

2000元

2300元

备注:会议费截止日期为2023年12月10日(含)。会议费中的住宿费计算方式是单间每天单价300元;如果两个参会人共住一个标间(同住一间的参会者需提前自行协商好,并在注册时注明),每人每天150元。

汇款银行信息

单位名称:水木未来(杭州)科技有限公司

纳税人识别号:91330185MA2KKQ6T4P

开户行:杭州银行临安支行

账号:3301040160019408577

地址:浙江省杭州市临安区青山湖街道大园路1623号地下一层

电话:0571-63711825

特别说明:

1. 银行汇款或扫码付款时请备注:冷冻电镜会议+参会姓名,请缴费后将汇款凭证、缴费人信息发送至大会联系人邮箱zhangxiaojing@tsinghua.edu.cn,邮件题目为:冷冻电镜会议+参会姓名,以便核对查询。

2. 凡已缴费的参会者因故不能参加,须在2023年12月10日(含)前以邮件的形式向大会联系人提出申请,会议费全额退款;2023年12月10日之后申请退款的,将扣除酒店住宿费用。

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